次忍界大战的来临越发的强烈，他开始进行各种残酷的人体实验，并改造自己的身体。这一天，他在自己的秘密基地里结束了一次实验。他从木叶的九尾人柱力漩涡玖辛奈身上取到了漩涡一族的细胞样本，他尝试着破解漩涡一族那独特体质的奥秘。
“大人，这是村子里传来的指令。”一名暗部手下在大蛇丸结束实验后，恭敬的递上了手里的指令书。大蛇丸接过一看，发现是村子委任他作为指挥官，负责指挥前线部队迎战砂忍。无论是实力还是名望，大蛇丸作为总指挥都可以服众。
虽然对此并不感兴趣，但想到战争时期就会死人，也就会有俘虏。到时候，他的实验材料也就有了着落。所以大蛇丸随手将指令书丢开后，笑道：“我知道了。”让手下看好这处秘密基地后，大蛇丸离开了这里，向着木叶的前线营地前进。
目前大蛇丸已经开始和志村团藏合作，两个人暗地里研究着血继限界的秘密，其中涉及许多不人道的实验。但无论是大蛇丸还是团藏对此都不在意，两个人都是为达目的不择手段的家伙。
只不过大蛇丸只对自己感兴趣的事情行动，团藏则在保护木叶及其利益这一点上不择手段。脑子里默默想着一些有关实验的事情，大蛇丸快速的在树林间穿梭。只不过在途径一处树林时，被里面的情况所吸引了。
看到那不正常的浓雾，大蛇丸来了兴趣。‘哦？是雾隐的忍术，看样子有只小老鼠跑到这附近来了啊……’大蛇丸停下脚步，然后向着浓雾当中走去。以他的实力可不担心什么，这是强者的自信。
虽然不是感知类型的忍者，但改造后的身体让大蛇丸拥有类似于蛇那样的热能感知，所以他能够知道浓雾里有两个人在战斗着。微微使用了一个风遁吹散了一些浓雾，大蛇丸看到了他感兴趣的东西。
专注于战斗中的两个人都没发现大蛇丸的到来，因此大蛇丸可以从容的观看着战斗的情况。当他看到其中一个是木叶忍者，还是开了写轮眼的宇智波忍者时，挑了挑眉。更让他讶然的是，作为那个宇智波忍者对手的，是一个不到十岁的小孩子。
只不过从对方的身手和表现来看，显然这个孩子有着超出年龄的实力与头脑。当最后两人近乎于同归于尽的一幕上演后，大蛇丸兴奋得颤抖起来。两个血继限界，其中一个还是他一直都很感兴趣的宇智波，大蛇丸觉得自己可以推迟下到前线的时间了。
想到这里，他缓缓走向那个雾隐少年。蹲到这个孩子旁边稍微查看了下，大蛇丸发现这小家伙还有一口气在。随后他又看了看那个宇智波忍者，对方瞪得大大的写轮眼以及那死不瞑目的样子让大蛇丸颇为不
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