政府迁都北京，盛京城成为清朝政府的“陪都重镇。”政治地位下降，经济地位上升。
1657年（清·顺治十四年）盛京城设立奉天府（奉天将军），从此，沈阳又有奉天之称。1663年（清·康熙二年）修建道观“太清丛林”（本名三教堂；今太清宫）于古城西北角。
1680年（清·康熙十九年），在盛京古城（奉天府）城外增筑一圈圆形周长16公里的夯土关墙，又设八个关，开设八个边门与内城的八门相对应1684年于古城大南门外修建两进院的佛庙般若寺。1707年始建锡伯族家庙（今太平寺）于皇寺西侧。
1752年（清·乾隆十七年）扩建，0000年（清·光绪二十八年）重修扩建。1765年（清·乾隆三十年）位于新民县镇南街的清真寺竣工，原寺为土草垒苫构筑，光绪年间重建为砖木结构建筑。
1803年（清·嘉庆八年）在回民聚集地修建清真东寺。后逐年扩建为经学院。如今在沈阳西部的新民县境内，可见当年清王朝修建的柳条边墙遗存。
沈阳四塔镇的到底是什么？
沈阳人都知道沈阳有四塔，东塔塔西塔南塔和北塔，按照正规史料的说话旧城城址的四角上，分别有东、西、南、北四座塔，塔边各有寺庙一座，即人们常说的“盛京四象”。它们是奉清太宗皇太极旨令，于崇德八年（1643年）建造的。
建塔的“理论依据”是：“一元生两仪、两仪生四象、四象生八卦”。“一元”，指皇宫凤凰楼，“两仪”指钟、鼓楼，“四象”指四塔；“八卦”指八门八关。
有民间传说中，说沈阳地下是一只巨龟，四塔就是它的四个脚，一有水灾，地震等灾害时候巨龟就托住沈阳。所以沈阳建城2300多年，从未有过任何大的灾害，是中国为数不多的福地之一。
另外还有个说法是皇太极时候，沈阳大旱多日，皇太极想尽办法也解决不了，只得发皇榜公告求高人解决。结果一个喇嘛揭了榜，说是当年东汉蔡伦造的第一张纸让上天拿走了，后来文殊菩萨好奇给偷去看，结果导致飘落人间，这张纸落到哪哪就有旱灾。
后来喇嘛说只要在沈阳建4座庙就能保平安，后来就按喇嘛说的做了，果然之后沈阳风调雨顺。
另外一种说法是，沈阳地下有王气，也就是帝王之气。当时清朝刚定都沈阳，看气的风水大师就告诉皇太极，沈阳有帝王之气冲天，如果不加以遏制，很快将有真龙出现，必然将危及大清的江山。
皇太极和诸贝勒一听可吓了一大跳，连忙找喇嘛和风水先生研究，最后，决定建四塔压制王气。虽然风水先生在沈阳四角找到四个“
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