但是，帝国政府的各项措施，并没有从根本上消除邪教。在帝国政府打击之下，隐藏得更深，伪装的更好。而一有风吹草动，他们马上死灰复燃。
无论是陕甘宁、晋冀鲁豫这些老解放区，还是中南半岛一带的吴哥省、交趾省，孟加拉省，以及湾湾岛、九州省，邪教分子们均蠢蠢欲动！
邪教危害最严重的地区，莫过于西北各省。
大明朝200年，帝国的西北部地区，一直存在着门宦与帝国政权对立。
门宦是内地宦门门阀一词的延伸，是中国秘密教派的特有组织。它上有教主，道堂，下有各种寺庙，组织非常严密。教主一呼百应，教徒唯命是从。各个门宦之间，各自独立，相互排斥，矛盾和冲突经常发生。
随着明末乱局的产生，帝国西北部一带，秘密教派内部又分裂出四大门宦，这些分裂主义分子，妄图在帝国的陕甘宁一带，建立政教合一的国家。
华夏帝国建立之后，周垣为了维护国家的统一，对门宦势力采取了严厉打击和极力压制的政策。尽管如此，门宦势力还是在境外反华势力支持下，发动了屠杀异教徒的叛乱，将矛头直接对准帝国的普通公民以及地方政府。
邪教叛军，以清除异教徒为理由，发动了所谓的圣战，进行了人类历史上最残忍的种族灭绝大屠杀。叛军血洗村庄八女井，将全村一万余口不分男女老幼集体屠杀。他们比希特勒屠杀犹太人手段更残酷。不分男女老幼，全部用刀砍死，用火烧死，进行种族灭绝大屠杀。不是为谋财，不是为谋地，单纯为杀人而杀人。
[转自铁血社叛乱一发生，大西北地区的邪教教徒纷起响应，短时间内形成了十多股势力，他们先后进攻，西安和潼关，一度威胁着陕晋豫的咽喉要地和山西滨河一带的地区。
华亭，隆德，平远，海城，固原五个地区，人口总损失百多万，占叛乱之前人口的八成、
平凉华亭县。邪教叛军入境，焚杀极惨。初叛之时，尚爱乡土，不甚残毒。后来，无所顾惜，焚杀惨于十倍。华亭从此丘墟。乡镇民屋焚杀殆尽，遗民数百悉逃莲花台。剿灭叛军之后，招安遗民，归城者仅七十余人，男女老幼死亡数万。”
平凉隆德县破城之后，从此官逃庄浪，城空无主者五年．人民杀毙饿死十有八九，老弱逃尽，全县无二三十人家。全县村村焦土，十室九空．人口死亡比例高达90％。
在庆阳县，四乡堡寨攻陷无遗，而县城独全，盖四乡之人逃出虎口者，生后入城避难。是月初九日，邪教叛军入城，全城糜烂，死者不知其数。叛乱之前，全县人口26.9万，战争损失23。4万，损失比例为87％。
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