明洪武十五年，西平侯沐英平定云南叛乱，而后沐英上书禀奏朱元璋，要求将士屯边云南，洪武皇帝朱元璋答应了沐英的奏折，之后沐英在云南戍边直到洪武二十五年，沐英在云南病逝。
洪武皇帝朱元璋追封沐英为黔宁王，而后沐英后世子孙世世代代戍边镇守云南，而吴三桂作为降清的明将汉人，希望得到的是皇帝的安抚。吴三桂希望自己可以像沐英一样，能够得到后世子孙永世为王，戍边云南这样的事情。
但是康熙皇帝却不答应。顺治十四年顺治皇帝驾崩，而此时的吴三桂早已经是镇守云南多年。恰逢大行皇帝驾崩镔天，吴三桂率军北上要祭奠顺治，昭圣太皇太后怕吴三桂会乘机叛乱。于是于诸王商议后，责令吴三桂在北京城外设棚拜祭即可，而不必与大军入城。
吴三桂北上之时，城外军马混乱百姓纷纷避走。“皇帝以此来撤藩，哀家自然是赞同皇帝的做法，但是三藩固然是顽疾，但是皇帝也是要有应对的措施才好啊。”昭圣太皇太后自然是知道皇帝肩负重担，但是这战乱一起就是硝烟弥漫，轻易不能下定决心的。
“孙儿闹翻老祖宗担忧了，朕自亲政以来以三藩，漕运和河务三件事为大事，夙兴夜寐而不敢忘怀。甚至以此来提醒朕自己，作为皇帝未完之事诸多。”康熙皇帝决定撤三藩，康熙七年，黄河泛滥淮扬发生水患，这开启了康熙皇帝治理河务之事。纳兰明珠作为弘文院大学士奉康熙皇帝圣命与工部尚书马尔塞一起调查淮扬水患一事。
马佳氏马尔塞与康熙皇帝的庶妃马佳氏系出同族，而又有不同的是，马佳氏这个庶妃与马尔塞不是族亲，马尔塞作为大学士三等公图海之孙，而马佳氏却是员外郎盖山之女。
不过康熙皇帝为了平衡前朝，会用后宫来做平衡物也不是没有道理的。而纳兰明珠更是仕途一帆风顺，从内务府郎中到内务府总管仅仅三年的时间，虽然是作为奴才的嫌疑洗脱不掉，但是八旗子弟本来就是爱新觉罗家的奴才。
康熙十二年十一月，平西王吴三桂诛杀云南巡抚朱国志。朱国志是汉军正黄旗人，顺治四年朱国志考取贡生被顺治皇帝授职固安知县，后胜任为大理寺卿。顺治十六年朱国志担任江苏巡抚，期间朱国志向顺治皇帝献策如何抵御郑成功的海军。
顺治皇帝二年，郑芝龙投降清朝，而郑成功却率领父亲郑芝龙的残余部队，继续在江南福建，浙江江苏一带继续与清兵斡旋。郑成功率领的郑家军，成为了南明后期抗击清朝的主要力量之一。郑成功一度的包围了江宁府但是因为军队悬殊太大，郑成功退败到了泉州的厦门和金门一带，继续积蓄力量与清朝抗衡。
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