次攻打均被学院击退后，都默认了学院的存在，在之后几百年的混战中都没有波及到学院的安危。
在五百年多前，大陆渐渐从各自为战的混战中慢慢结合起来，最终在三百年前形成了现在的大陆格局，形成以四大禁地为界的四大帝国和中心区域的光明教会，而魔武学院也一如既往地在大陆一隅默默发展。
大陆各国高层在战事平静下来后才发现偏安一隅的魔武学院也已经发展了进来，他们的城墙也如大陆各国的都城一样高矗宽厚，而且学院里的学生老师都武技高强、魔法高深，近千年的大陆混战对于魔武学院并没有丝毫影响，他们的武技、魔法依然保存完好，不像大陆各国一样，很多的技艺都在混战中失传。大陆各国都曾经想过要再次攻打魔武学院，将学院的书藉据为己有，但又怕被其他国家趁虚而入，动摇了本国根本。无奈之下，大陆各国都派出使者，向魔武学院要求结盟，将魔武学院视为同行的盟友，每年都会向学院捐赠大量物资，唯一的要求就是本国可以派出达到学院要求的学生进入魔武学院学习。
当时魔武学院的院长为了以后学院的发展和安定，同意了各国的要求，在光明教会的见证下各国与魔武学院同时签下了同盟协议，魔武学院也成为了一所大陆公认的魔武学院。学院没有名字，魔法、武技就是它的全部，所以魔武学院的名字就一直沿用下来了。每个魔武学院都为大陆各国输送了大量的人才，现在大陆各国军中高层，大多曾经在魔武学院进修过，有的更是被上层直接从魔武学院中发掘出来的，所以魔武学院也被誉为通向成功的摇篮，从而吸引了大量的适龄孩童前来报名，想要做学院的威名为自己的档案加上光亮的一笔。
由于报名人数过多，学院不得不将入学门槛定得再高一些，每年只收取资质最好的前五千名学生入学进修，落选的可以下一年再来报名，但最高报名年龄不能超过二十岁，因为到二十岁后再学习以后的成就不可能有多高了。不过，学院也为落选的学生提供一些简单修炼方法，让他们即使不能进入学院也一样可以学习。
魔武学院分为武技分院和魔法分院，每个分院都分五个年级，每年通过考核的学生可以进入下一个年级继续学习，不能通过的学生将重新修炼本年级的知识，直到下一年的考核及格为止，如果三次不及格将被勒令退学。
武技分院按战士技能分为剑士班、骑士班、盗贼班、斗士班和特殊职业班，特殊职业班包括弓箭手和魔剑士这一类人数比较少，但仍然很有特点和威力的职业的混合班级。
魔法学院按魔法元素和一些特殊魔法分为八个班，特殊魔法班
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